畜禽糞便是中國傳統的優質有機肥料。增施有機肥，可減少化肥使用量，改良土壤結構，顯著提高農產品品質，是促進農業可持續發展、生產無公害農產品的重要措施。對集約化養殖場畜禽糞便進行無害化處理與肥料化利用，不僅可有效解決集約化畜禽養殖場環境污染問題，防治農業面源污染，實現畜牧業清潔生產，還可生產優質有機肥料產品，而且根據現在環保要求，使用畜禽糞便處理設備好氧發酵技術更能推進有機肥料使用。

自然堆漚發酵法

自然堆漚發酵法將畜禽糞便堆放在發酵池里，用秸稈將表面覆蓋，經過長時間的自然厭氧發酵(有的長達幾年)，到施肥季節時，直接施入地里。這種方式在偏遠地區的小農場曾廣泛采用，其主要原因:一是小農場地處偏遠地區，遠離居民區，地域遼闊;二是自然堆漚發酵好的肥料在小農場內部就近使用，不必遠距離運輸。但中國集約化畜禽養殖場大多集中在城市郊區，離居民區很近，周圍沒有大量土地可以就近消納源源不斷產生的畜禽糞便。

晾曬干燥法

晾曬干燥法是將畜禽糞便均勻攤放在場地上，利用太陽能進行自然干燥。該方法投資少，成本低，但占地面積大，環境污染嚴重，肥料養分損失多，且雨雪季節難以正常生產，產品較難達到無害化要求。該方法適合于畜禽散養戶處理零星畜禽糞便，不適合于集約化畜禽養殖場處理量大而集中的畜禽糞便。

直接快速烘干法

直接快速烘干法是采用高溫熱煙道氣將畜禽糞便直接烘干、滅菌，并將產品含水率控制在安全貯存水分以下的快速處理方法。直接快速烘干法具有快速加工、操作簡單、產品質量好、不受氣候限制和可連續生產等優點，20世紀90年代曾被廣泛應用于集約化養雞場的糞便處理。但該方法能耗較高，烘干尾氣處理不當易造成二次污染。因此，當畜禽糞便含水率高或在煤炭資源短缺、環保要求高的地區，其使用性受到限制。

畜禽糞便處理設備好氧發酵法

高溫好氧發酵，4小時除臭、48小時出肥，產生有機肥成本低，經濟效益顯著，分層發酵，熱量循環，降低能耗，多層疊式設計，占地面積小，全自動控制，減少技術人員和運營成本，不銹鋼材質，使用壽命長，可處理多種糞污、多種配套菌種可選

沼氣厭氧發酵法

是以畜禽場的糞便為原料，在沼氣發酵裝置中，在隔絕氧氣的條件下，通過微生物的作用，最終將其中的碳元素分解為可燃氣體（沼氣）。沼氣厭氧發酵法適于處理集約化畜禽養殖場采用水沖式(或水泡式)清糞工藝的液態畜禽糞尿。