1、種養結合模式

以生豬、肉牛、蛋雞、肉雞和羊規模養殖場的固體糞便為主，經好氧堆肥無害化處理后，就地農田利用或生產有機肥。

主要優點：好氧發酵溫度高，糞便無害化處理較徹底，發酵周期短；堆肥處理提高糞便的附加值。

適用范圍：適用于只有固體糞便、無污水產生的家禽養殖場或羊場等。

2、清潔回用模式（糞便基質化利用模式）

以畜禽糞污、菌渣及農作物秸稈等為原料，進行堆肥發酵，生產基質盤和基質土應用于栽培果菜。

主要優點：畜禽糞污、食用菌廢棄菌渣、農作物秸稈三者結合，科學循環利用，實現農業生產鏈零廢棄、零污染的生態循環生產，形成一個有機循環農業綜合經濟體系，提高資源綜合利用率。

適用范圍：該模式既適用大中型生態農業企業，又適合小型農村家庭生態農場，同時適合小型農村家庭農場分工、聯合經營。

3、清潔回用模式（糞便墊料化利用模式）

基于奶牛糞便纖維素含量高、質地松軟的特點，將奶牛糞污干濕分離后，固體糞便進行好氧發酵無害化處理后回用作為牛床墊料，污水貯存后作為肥料進行農田利用。

主要優點：牛糞替代沙子和土作為墊料，減少糞污后續處理難度。

適用范圍：適用于規模奶牛場。